Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KPNA1P52294 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms