Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC3P51654 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms