Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NESP48681 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NESP48681 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NESP48681 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NESP48681 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NESP48681 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms