Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFMP43652 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AFMP43652 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AFMP43652 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AFMP43652 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms