Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms