Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms