Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms