Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CASQ1P31415 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASQ1P31415 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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