Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP1P29466 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms