Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms