Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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