Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF1P21675 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF1P21675 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms