Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4AP20338 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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