Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DESP17661 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DESP17661 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms