Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms