Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms