Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms