Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHGAP10645 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHGAP10645 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHGAP10645 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms