Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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