Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms