Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC24DO94855 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC24DO94855 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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