Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms