Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms