Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms