Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms