Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HELTA6NFD8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms