Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms