Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSDA5PKW4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms