Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRD1A4D1F6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms