Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFG3L2Q9Y4W6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms