Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms