Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms