Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAJB4Q9UDY4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms