Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms