Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNKQ9P0W0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFNKQ9P0W0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms