Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOMER3Q9NSC5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOMER3Q9NSC5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms