Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHACTR1Q9C0D0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms