Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms