Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARD11Q9BXL7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms