Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLVAPQ9BX97 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms