Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms