Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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