Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms