Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 464.8 ms