Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH4Q99466 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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