Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms