Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms