Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms