Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FUBP1Q96AE4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FUBP1Q96AE4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms