Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHF3Q92576 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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